该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅ggcyto。
生物导体版本:3.12
通过针对Flowset,NCDFFLOWSET和Gatingset类实施的专用强化方法,可以用GGPLOT直接绘制原始和门控流式细胞术数据。GGCYTO包装纸和一些定制层也使得在该图中添加大门和人口统计数据变得容易。
作者:迈克·江
维护者:Mike Jiang
引用(从r内,输入引用(“ ggcyto”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ggcyto”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ ggcyto”)
html | R脚本 | GGCYTO的功能摘要 |
html | R脚本 | 快速的细胞仪数据图 |
html | R脚本 | 用ggcyto可视化流量 |
html | R脚本 | 用ggcyto可视化gatingset |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,流程仪,,,,免疫学,,,,基础设施,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 方法,GGPLOT2(> = 3.3.0),流核(> = 1.41.5),ncdfflow(> = 2.17.1),FlowWorkspace(> = 3.33.1) |
进口 | plyr,,,,秤,,,,Hexbin,,,,Data.Table,,,,rcolorbrewer,,,,栅格,,,,rlang |
链接 | |
建议 | 测试,,,,FlowWorkspacedata,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,FlowStats,,,,opencyto,,,,Flowviz,,,,Ggridges,,,,VDIFFR |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/rglab/ggcyto/issues |
取决于我 | |
进口我 | 细胞瘤 |
建议我 | 催化剂,,,,流核,,,,流动时间,,,,FlowWorkspace,,,,opencyto |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ggcyto_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | ggcyto_1.18.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | ggcyto_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggcyto |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ggcyto |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ggcyto/ |
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