gtrellis

DOI:10.18129 / B9.bioc.gtrellis

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见gtrellis．

基因组级网格布局

Bioconductor版本:3.12

基因组水平格状图通过基因组类别(例如染色体)来可视化基因组数据。对于每个基因组类别，用轨迹表示的多维数据从不同方面描述了不同的特征。这个包提供了高度的灵活性来安排基因组类别，并在图中添加自定义图形。

作者:Zuguang顾

维护人员:Zuguang Gu

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“gtrellis”)

超文本标记语言	R脚本	制作基因组级格状图
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序，软件，可视化
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R(>= 3.1.2)，网格，IRanges，GenomicRanges
进口	circlize(> = 0.4.8),GetoptLong、grDevices跑龙套
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),knitr，RColorBrewer，减价，ComplexHeatmap(> = 1.99.0),开罗，png，jpeg，tiff
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/gtrellis
取决于我
进口我	YAPSA
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	gtrellis_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	gtrellis_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	gtrellis_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gtrellis
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/gtrellis/
包下载报告	下载数据