H5VC

doi：10.18129/b9.bioc.h5vc

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅H5VC。

使用HDF5后端管理对齐时间

生物导体版本：3.12

该软件包包含与HDF5文件中存储的NGS实验的TALLY数据交互的功能。

作者：Paul Theodor Pyl

维护者：paul theodor pyl

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ h5vc”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ H5VC”）

html	R脚本	用H5VC构建最小的基因组浏览器
html	R脚本	H5VC-游览
PDF		参考手册

细节

生物浏览	软件
版本	2.24.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（7。5年）
执照	GPL（> = 3）
要看	网格，栅格，，，，GGPLOT2
进口	RHDF5，，，，重塑，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，生物弦，，，，rsamtools（> = 1.99.1），方法，基因组机，，，，艾宾，，，，生物比较，，，，batchjobs，，，，H5VCDATA，，，，GenomeInfodB
链接	Rhtslib（> = 1.15.3）
建议	尼特，，，，Locfit，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，Biomart，，，，bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38，，，，运行，，，，生物基因
系统要求	gnu做
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	H5VCDATA
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	h5vc_2.24.0.tar.gz
Windows二进制	h5vc_2.24.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	H5VC_2.24.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/h5vc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/h5vc
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/h5vc/
软件包下载报告	下载统计