hipathia

DOI:10.18129 / B9.bioc.hipathia

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见hipathia。

HiPathia:高通量通路分析

Bioconductor版本:3.12

Hipathia是一种基于转录组学数据计算信号转导的方法。该方法基于迭代算法，通过考虑每个基因的表达水平和到达它的信号强度，可以计算通过网络节点的信号强度。它还提供了一种新的功能分析方法，允许计算到达每个路径注释的功能的信号。

作者:Marta R. Hidalgo [aut, cre]， joss Carbonell-Caballero [cbc]， Francisco Salavert [cbc]， Alicia Amadoz [cbc]， Çankut Cubuk [cbc]， Joaquin Dopazo [cbc]

维护者:Marta R. Hidalgo < Marta。伊达尔戈在展望

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("hipathia")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“hipathia”)

PDF	R脚本	Hipathia包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去，GeneExpression，GeneSignaling，GraphAndNetwork，通路，软件
版本	2.6.0
在Bioconductor中	BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6)，igraph(> = 1.0.1),AnnotationHub(> = 2.6.5),MultiAssayExperiment(> = 1.4.9),SummarizedExperiment(> = 1.8.1)
进口	硬币统计数据,limma、设备、工具、图形、preprocessCore，servr，DelayedArray，matrixStats、方法、S4Vectors
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	hipathia_2.6.0.tar.gz
Windows二进制	hipathia_2.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	hipathia_2.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hipathia
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/hipathia
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/hipathia/
软件包下载报告	下载数据