核粒子

doi：10.18129/b9.bioc.karyoploter

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅核粒子。

绘制显示任意数据的可自定义线性基因组

生物导体版本：3.12

Karyoploter创建了任意基因组的核型图，并提供了完整的功能来绘制其上的任意数据。它模仿许多R基本图形功能将它们与坐标更改函数结合起来，将染色体和数据坐标自动映射到图坐标中。除了提供的数据绘图函数外，添加新的功能也很容易。

作者：bernat gel

维护者：igtp.cat上的bernat凝胶

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ karyoploter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“核粒子”）

html	R脚本	Karyoploter Vignette
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	chipseq，，，，库务，，，，覆盖范围，，，，dnaseq，，，，DataImport，，，，甲基，，，，Onechannel，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.16.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（4年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.4），区域人，，，，基因组机， 方法
进口	区域人，，，，基因组机，，，，iranges，，，，rsamtools，统计，图形，备忘录，，，，rtracklayer，，，，GenomeInfodB，，，，S4VECTORS，，，，Biovizbase，，，，消化，，，，Bezier，，，，GenomicFeatures，，，，bamsignals，，，，AnnotationDbi，grdevices，变体
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，测试，，，，马格里特，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，pasillabamsubset
系统要求
增强
URL	https://github.com/bernatgel/karyoploter
BugReports	https://github.com/bernatgel/karyoploter/issues
取决于我	库务
进口我	cnvfilter，，，，Multicrispr，，，，ripat
建议我	类别
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	karyoploter_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	karyoploter_1.16.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	karyoploter_1.16.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/karyoploter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/karyoploter
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/karyoploter/
软件包下载报告	下载统计