MCSEA

doi：10.18129/b9.bioc.mcsea

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅MCSEA。

甲基化的CPG集富集分析

生物导体版本：3.12

使用Illumina的450K或Epic微阵列数据，从人类基因组中鉴定了预定义区域（启动子，CpG岛...）中差异甲基化区域（DMR）的鉴定。提供基于线性模型对CPG探针进行排名的方法，并包括绘图功能。

作者：Jordi Martorell-Marugán和Pedro Carmona-Sáez

维护者：jordi martorell-marugán

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ mcsea”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ MCSEA”）

PDF	R脚本	使用MCSEA软件包的预定义DMR识别
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，表观遗传学，，，，遗传学，，，，基因数，，，，免疫学，，，，甲基化array，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，软件，，，，两通道
版本	1.10.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.5），McSeadata，，，，同性恋
进口	Biomart，，，，fgsea，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，GGPLOT2，图形，grdevices，GVIZ，，，，iranges，，，，林玛，方法，并行，S4VECTORS，统计总结性特征，UTILS
链接
建议	生物酶，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，Flowsorted.blood.450k，，，，尼特，，，，白血病，，，，Minfi，，，，Minfidata，，，，rmarkDown，，，，运行
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	mcSea_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	MCSEA_1.10.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	MCSEA_1.10.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mcsea
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/mcSea
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/mcsea/
软件包下载报告	下载统计