metaseqr

doi：10.18129/b9.bioc.metaseqr

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.12版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅metaseqr（请参阅替换MetaseQR2）。

通过组合多种统计算法，用于分析RNA-SEQ数据的R软件包。

生物导体版本：3.12

为RNA-Seq基因表达数据提供了几个归一化和统计测试包的接口。此外，它创建了几个诊断图，通过结合几个统计测试的结果并以交互式方式报告结果，从而执行荟萃分析。

作者：panagiotis moulos

维护者：panagiotis moulos

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ metaseqr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ metaseqr”）

PDF	R脚本	使用MetaseQR的Mulitple统计算法的RNA-Seq数据分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，正常化，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，软件，，，，工作流程
版本	1.30.0
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（7年）
执照	GPL（> = 3）
要看	r（> = 3.4.0），EDASEQ，，，，deseq，，，，林玛，，，，QVALUE
进口	EDGER，，，，Noingsq，，，，贝塞克，，，，NBPSEQ，，，，Biomart，utils，GPLOTS，，，，Corrplot，，，，VSN，，，，酿造，，，，rjson，，，，log4r
链接
建议	生物基因，，，，基因组机，，，，rtracklayer，，，，rsamtools，，，，survomp，，，，Venndiagram，，，，尼特，，，，动物园，，，，运行，，，，生物管理器，，，，BSGENOME，，，，rsqlite
系统要求
增强	平行，TCC，，，，rmysql
URL	http://www.fleming.gr
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metaseqr_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	METASEQR_1.30.0.ZIP
MacOS 10.13（高山脉）	metaseqr_1.30.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metaseqr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/metaseqr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/metaseqr/
软件包下载报告	下载统计