甲基分析

doi：10.18129/b9.bioc.Methyanalysis

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅甲基分析。

DNA甲基化数据分析和可视化

生物导体版本：3.12

甲基分析套件旨在进行DNA甲基化数据分析和可视化。定义了Methygenoset类，以将染色体位置信息与数据保持一致。该软件包还包括估计Methy-Seq数据中甲基化水平的功能。

作者：Pan Du，Richard Bourgon

维护者：lei huang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ methyanalysis”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“甲基分析”）

PDF	R脚本	甲基分析套件的介绍
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，微阵列，，，，软件，，，，可视化
版本	1.32.0
在生物导体中	Bioc 2.11（R-2.15）（8。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 2.10），网格，生物基因，，，，iranges，，，，GenomeInfodB（> = 1.22.0），基因组机，，，，生物酶（> = 2.34.0），org.hs.eg.db
进口	grdevices，统计，utils，Lumi，，，，甲基菌，，，，GVIZ，，，，Genoset，，，，总结性特征，，，，iranges，，，，基因组机，，，，变体，，，，rtracklayer，，，，BigMemoryExtras，，，，GenomicFeatures，，，，注释，，，，生物酶（> = 2.5.5），AnnotationDbi，，，，GeneFilter，，，，Biomart，方法，并行
链接
建议	FDB.Infinium -Methylation.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	甲基菌
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Methyanalysis_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	Methyanalysis_1.31.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Methyanalysis_1.32.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methyanalysis
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基分析
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/methyanalysis/
软件包下载报告	下载统计