methylCC

DOI:10.18129 / B9.bioc.methylCC

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见methylCC。

估计DNA甲基化样本中全血的细胞组成

Bioconductor版本:3.12

在任何平台技术(微阵列和测序)上估计DNA甲基化全血样本的细胞组成的工具。

作者:斯蒂芬妮·c·希克斯[作家，作家]拉斐尔·伊扎里(Rafael Irizarry)

维护者:Stephanie C. Hicks < shicks19@jhu.edu >

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("methylCC")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“methylCC”)

超文本标记语言	R脚本	methylCC用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，MethylSeq，MethylationArray，微阵列，测序，软件，WholeGenome
版本	1.4.0
在Bioconductor中	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	Cc 4.0
取决于	R (>= 3.6)，FlowSorted.Blood.450k
进口	Biobase，GenomicRanges，IRanges，S4Vectors，dplyr，magrittr，minfi，bsseq，quadprog，plyranges，统计，utils，bumphunter，genefilter、方法、IlluminaHumanMethylation450kmanifest，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19
链接
建议	knitr，testthat(> =魅惑,BiocGenerics，BiocStyle，tidyr，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
BugReports	https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	methylCC_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	methylCC_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	methylCC_1.4.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/methylCC
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/methylCC
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/methylCC/
软件包下载报告	下载数据