miRspongeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRspongeR

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见miRspongeR．

miRNA海绵相互作用网络和模块的鉴定和分析

Bioconductor版本:3.12

该软件包提供了研究miRNA海绵(也称为ceRNA或miRNA诱饵)的几种功能，包括识别miRNA海绵相互作用的流行方法，整合不同方法的miRNA海绵相互作用的集成方法，以及验证miRNA海绵相互作用的功能，并推断miRNA海绵模块，进行模块富集分析，进行模块生存分析。

作者:Junpeng张

维护人员:Junpeng Zhang

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" mirsponge ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“miRspongeR”)

超文本标记语言	R脚本	mirsponer: miRNA海绵相互作用网络和模块的识别和分析
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文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，GeneExpression，微阵列，NetworkEnrichment，软件，生存
版本	1.16.2
Bioconductor自	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	corpcor平行,igraph，制程，clusterProfiler，ReactomePA，剂量，生存， grDevices，图形，统计，varhandle，linkcomm跑龙套,Rcpp，org.Hs.eg.db
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/zhangjunpeng411/miRspongeR/issues
取决于我
进口我	miRSM
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	miRspongeR_1.16.2.tar.gz
Windows二进制	miRspongeR_1.16.2.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	miRspongeR_1.16.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRspongeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRspongeR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/miRspongeR/
包下载报告	下载数据