马赛克

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaics

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见马赛克．

MOSAiCS(基于模型的ChIP-Seq一和二样本分析和推断)

Bioconductor版本:3.12

该软件包提供了MOSAiCS和MOSAiCS- hmm的拟合功能，MOSAiCS- hmm是一个统计框架，用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或双样本ChIP-seq数据。

作者:钟东军，裴芬宽，Rene Welch, Sunduz Keles

维护者:Dongjun Chung < Dongjun。钟在gmail.com >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“马赛克”)

PDF	R脚本	马赛克
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，ChIPseq，遗传学，测序，软件，转录
版本	2.28.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (R-2.13)(10年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.0.0)，方法，图形，Rcpp
进口	质量样条函数,晶格，IRanges，GenomicRanges，GenomicAlignments，Rsamtools，GenomeInfoDb，S4Vectors
链接	Rcpp
建议	mosaicsExample
SystemRequirements	Perl
增强了	平行
URL	http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	mosaics_2.28.0.tar.gz
Windows二进制	mosaics_2.28.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	mosaics_2.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/马赛克
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mosaics/
包下载报告	下载数据