myvariant

DOI:10.18129 / B9.bioc.myvariant

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见myvariant

访问MyVariant.info变量查询和注释服务

Bioconductor版本:3.12

info是变体注释资源的综合聚合。myvariant是查询myvariant .info服务的包装器

作者:亚当·马克

维护者:Adam Mark, Chunlei Wu

引文(从R内,输入引用(“myvariant”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“myvariant”)

PDF R脚本 使用MyVariant。R
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释GenomicVariation软件VariantAnnotation
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.2.1),VariantAnnotation
进口 httrjsonliteS4VectorsHmiscplyrmagrittrGenomeInfoDb
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 myvariant_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 myvariant_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) myvariant_1.20.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/myvariant
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/myvariant
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/myvariant/
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