该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Ontoproc。
生物导体版本:3.12
支持收集各种生物信息学本体论,特别是在Cran上使用了OntologyIndex软件包。我们提供有关细胞,细胞系,化合物和解剖结构术语的关键本体论的快照,以帮助分析基因组规模实验,尤其是细胞X化合物筛选。另一个目的是加强引人注目的用例开发,以使其富裕的界面成为新的本体论。
作者:Vince Carey
维护者:vj Carey
引用(从r内,输入引用(“ Ontoproc”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ontoproc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Ontoproc”)
html | R脚本 | ONTOPROC:一些面向本体的用单细胞焦点用于生物导体 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 去,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.5),Ontology Indexex |
进口 | 生物酶,,,,S4VECTORS, 方法,AnnotationDbi,统计,utils,Biocfilecache,,,,闪亮的,,,,图形,,,,rgraphviz,,,,本体学图,,,,dplyr,,,,马格里特,,,,DT,,,,Igraph |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,测试,,,,生物使用,,,,Singlecellexperiment,,,,CellDex |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | pogos,,,,tenxplore |
建议我 | Bioconcotk,,,,txreginfra |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ontoproc_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | ontoproc_1.12.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | ontoproc_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ontoproc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/ontoproc |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ontoproc/ |
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