此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见网页排名.
Bioconductor版本:3.12
实现了由Rozenshtein和Gionis定义的时态PageRank分析。实现了Halu等人定义的多路PageRank。PageRank在基因调控网络分析中的应用。
作者:丁鸿旭[aut, cre, ctb, cph]
维护者:丁宏旭
引文(从R内,输入引用(“pageRank”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pageRank")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“pageRank”)
R脚本 | introduction.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneTarget,网络,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 4.0) |
进口 | GenomicRanges,igraph,motifmatchr,统计,utils, grDevices,图形 |
链接 | |
建议 | bcellViper,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,JASPAR2018,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,org.Hs.eg.db,TFBSTools,GenomicFeatures,注释 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/hd2326/pageRank |
BugReports | https://github.com/hd2326/pageRank/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | pageRank_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | pageRank_1.0.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | pageRank_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pageRank |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pageRank |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/pageRank/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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