panelcn.mops

DOI:10.18129 / B9.bioc.panelcn.mops

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见panelcn.mops。

针对NGS面板数据的CNV检测工具

Bioconductor版本:3.12

针对NGS面板数据的CNV检测工具。cn的扩展。拖把包。

作者:Verena Haunschmid, Gundula Povysil

维护者:Gundula Povysil < Povysil at bioinfo .jku.at>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("panelcn.mops")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“panelcn.mops”)

PDF	R脚本	panelcn.mops: Manual for the R package
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，CopyNumberVariation，遗传学，GenomicVariation，测序，软件，VariantDetection
版本	1.12.0
在Bioconductor中	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	LGPL (>= 2.0)
取决于	R (>= 3.4)，cn.mops，方法，utils，统计，图形
进口	GenomicRanges，Rsamtools，IRanges，S4Vectors，GenomeInfoDb, grDevices
链接
建议	knitr，rmarkdown，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我	CopyNumberPlots
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	panelcn.mops_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	panelcn.mops_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	panelcn.mops_1.12.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panelcn.mops
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/panelcn.mops
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/panelcn.mops/
软件包下载报告	下载数据