这个包裹是弃用.它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。
此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见pathprintGEOData.
Bioconductor版本:3.12
将作为表达表或GEO引用提供的基因表达数组转换为“通路指纹”的算法,“通路指纹”是一组通路中表示高(1)、低(-1)或不重要(0)表达的离散三元分数向量。
作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis
维护者:Sokratis Kariotis
引文(从R内,输入引用(“pathprint”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | GeneExpression,KEGG,Reactome,软件,转录 |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(4年) |
许可证 | GPL |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | 统计,跑龙套 |
链接 | |
建议 | 所有,GEOquery,pathprintGEOData,SummarizedExperiment |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | pathprintGEOData |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprint |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pathprint |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/pathprint/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
支持»
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