pathprint

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprint

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此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本,请参见pathprintGEOData

基因表达阵列分析的通路指纹

Bioconductor版本:3.12

将作为表达表或GEO引用提供的基因表达数组转换为“通路指纹”的算法,“通路指纹”是一组通路中表示高(1)、低(-1)或不重要(0)表达的离散三元分数向量。

作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis

维护者:Sokratis Kariotis

引文(从R内,输入引用(“pathprint”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpressionKEGGReactome软件转录
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证 GPL
取决于 R (>= 3.4)
进口 统计,跑龙套
链接
建议 所有GEOquerypathprintGEODataSummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 pathprintGEOData
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprint
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pathprint
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pathprint/
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