doi:10.18129/b9.bioc.phenotest

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅

以高效,结构化,快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间关联的工具。我们还提供了进行GSEA(基因集富集分析)和拷贝数变化的工具。

生物导体版本:3.12

以高效,结构化,快速和可扩展的方式测试基因表达和表型之间相关性的工具。还提供了GSEA。

作者:evarist星球

维护者:evarist星球

引用(从r内,输入引用(“表巨人”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ phenotest”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“表巨人”)

PDF R脚本 表格最图书馆的手册
PDF 参考手册

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,差异性,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,软件
版本 1.38.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(10年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.12.0),生物酶, 方法,注释,,,,热倍,,,,BMA,,,,GGPLOT2,,,,HMISC
进口 生存,,,,林玛,,,,GPLOTS,,,,类别,,,,AnnotationDbi,,,,霍巴赫,,,,Biomart,,,,gseabase,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,注释,,,,MGCV,,,,HGU133A.DB,,,,椭圆
链接
建议 gseabase,,,,kegg.db,,,,go.db
系统要求
增强 平行,org.ce.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,org.dm.eg.db
URL
取决于我
进口我 癌症
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Phanotest_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 PANTOTEST_1.38.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) PANTOTEST_1.38.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenotest
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/表格
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/phenotest/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户