该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅钢琴。
生物导体版本:3.12
钢琴使用各种统计方法,来自不同的基因水平统计和广泛的基因组集合进行基因集分析。此外,钢琴包包含用于组合多个基因集分析结果的功能。
作者:gmail.com上的leif Varemo Wigge <钢琴<钢琴rpkg和intawat nookaew
维护者:leif Varemo Wigge <钢琴。rpkgat gmail.com>
引用(从r内,输入引用(“钢琴”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“钢琴”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“钢琴”)
R脚本 | 钢琴 - OMIC数据集成分析平台 | |
html | R脚本 | 与钢琴一起运行Gene-Set Anaysis |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,微阵列,,,,途径,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 2.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(8年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 3.5) |
进口 | 生物基因,,,,生物酶,,,,GPLOTS,,,,Igraph,,,,关系,,,,Marray,,,,fgsea,,,,闪亮的,,,,DT,,,,htmlwidgets,,,,Shinyjs,,,,发光的dashboard,,,,Visnetwork,,,,秤,grdevices,图形,统计,utils,方法 |
链接 | |
建议 | 酵母2.DB,,,,RSBML,,,,plotrix,,,,林玛,,,,副词,,,,钳子,,,,affyplm,,,,gtools,,,,Biomart,,,,降雪,,,,AnnotationDbi,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.sysbio.se/piano |
BugReports | https://github.com/varemo/piano/issues |
取决于我 | |
进口我 | coregx |
建议我 | BloodCancermultiomics2017 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | 钢琴_2.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | 钢琴_2.6.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | 钢琴_2.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/piano |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/钢琴 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/piano/ |
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