proBAMr

DOI:10.18129 / B9.bioc.proBAMr

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见proBAMr．

在鸟枪蛋白质组数据中为psm生成SAM文件

Bioconductor版本:3.12

将psm映射回基因组。该包还提供了从GTF文件中准备注释的功能。

作者:王晓静

维护者:王小菁<小菁。Wang在vanderbilt。edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("proBAMr")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“proBAMr”)

PDF	R脚本	proBAMr简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.0.1)，IRanges，AnnotationDbi
进口	GenomicRanges，Biostrings，GenomicFeatures，rtracklayer
链接
建议	RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	proBAMr_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	proBAMr_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	proBAMr_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proBAMr
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/proBAMr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/proBAMr/
软件包下载报告	下载数据