Proda

doi:10.18129/b9.bioc.proda

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Proda

无标签质谱数据的差异丰度分析

生物导体版本:3.12

在没有归类的无标签质谱数据中说明缺失值。该软件包实现了一个概率辍学模型,该模型可确保正确组合观察到和缺失值的信息。它增加了经验性的贝叶斯先验,以增加检测差异丰富蛋白质的功率。

作者:康斯坦丁·艾尔曼·埃尔特兹[AUT,CRE],西蒙·安德斯[THS]

维护者:constantin ahlmann-teltze

引用(从r内,输入引用(“ Proda”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ proda”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Proda”)

html R脚本 数据导入
html R脚本 介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,差异性,,,,质谱,,,,正常化,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,回归,,,,软件
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年)
执照 GPL-3
要看
进口 统计,utils,方法,生物基因,,,,总结性特征,,,,S4VECTORS,,,,渡轮
链接
建议 测试(> = 2.1.0),MSNBase,,,,dplyr,,,,Stringr,,,,readr,,,,花花公子,,,,蒂布尔,,,,林玛,,,,dep,,,,numderiv,,,,pheatmap,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/const-ae/proda
BugReports https://github.com/const-ae/proda/issues
取决于我
进口我
建议我 Protti
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 proda_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 proda_1.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) proda_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proda
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/proda
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/proda/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户