qpgraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.qpgraph

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见qpgraph．

从高通量基因组学数据估计遗传和分子调控网络

Bioconductor版本:3.12

从高通量表达和基因分型分析中估计基因和eQTL网络。

作者:Robert Castelo [aut, cre]， Alberto Roverato [aut]

维护者:Robert Castelo < Robert。卡斯特罗访问upf.edu>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“qpgraph”)

PDF		BasicUsersGuide.pdf
PDF	R脚本	使用qpgraph估计eQTL网络
PDF	R脚本	利用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程
PDF	R脚本	用qpgraph模拟分子调控网络
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneRegulation，GeneticVariability，遗传学，GraphAndNetwork，微阵列，NetworkInference，通路，单核苷酸多态性，软件，转录
版本	2.24.3
在Bioconductor公司	BioC 2.4 (R-2.9)(12年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.5)
进口	方法、并行矩阵(>= 1.0)， grid，注释，图(> = 1.45.1),Biobase，S4Vectors，BiocParallel，AnnotationDbi，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，GenomicFeatures，mvtnorm，qtl，Rgraphviz
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，genefilter，org.EcK12.eg.db，rlecuyer，雪，类别，GOstats
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/rcastelo/qpgraph
BugReports	https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues
全靠我
进口我	限幅器
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	qpgraph_2.24.3.tar.gz
Windows二进制	qpgraph_2.24.3.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	qpgraph_2.24.3.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qpgraph
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qpgraph/
软件包下载报告	下载数据