rGREAT

DOI:10.18129 / B9.bioc.rGREAT

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见rGREAT．

GREAT分析客户端

Bioconductor版本:3.12

该软件包通过根据用户输入构建HTTP POST请求，自动从GREAT web服务器检索结果，使GREAT (Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool)分析自动化。

作者:顾祖光

维护者:祖光谷

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("rGREAT")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rGREAT”)

超文本标记语言	R脚本	用GREAT分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	报道，去，GeneSetEnrichment，GenomeAnnotation，通路，测序，软件，WholeGenome
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.1.2)，GenomicRanges，IRanges、方法
进口	rjson，GetoptLong(> = 0.0.9),RCurl， utils，统计
链接
建议	testthat(> = 0.3),knitr，circlize(> = 0.4.8),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/rGREAThttp://great.stanford.edu/public/html/
全靠我
进口我	profileplyr
建议我	TADCompare
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	rGREAT_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	rGREAT_1.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	rGREAT_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rGREAT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rGREAT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rGREAT/
软件包下载报告	下载数据