rTRM

DOI:10.18129 / B9.bioc.rTRM

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见rTRM．

从PPI网络中识别转录调控模块

Bioconductor版本:3.12

rTRM识别蛋白质-蛋白质相互作用网络中的转录调节模块(TRMs)。

作者:迭戈Diez

维护者:Diego Diez

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“rTRM”)

PDF	R脚本	介绍rTRM
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation，GraphAndNetwork，网络，软件，转录
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10),igraph(> = 1.0)
进口	AnnotationDbi，DBI，RSQLite
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，MotifDb，图，PWMEnrich，biomaRt，knitr，Biostrings，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ddiez/rTRM
BugReports	https://github.com/ddiez/rTRM/issues
取决于我
进口我	rTRMui
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	rTRM_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	rTRM_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	rTRM_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rTRM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rTRM
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rTRM/
包下载报告	下载数据