randRotation

DOI:10.18129 / B9.bioc.randRotation

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见randRotation

批处理结构高维数据的随机旋转方法

Bioconductor版本:3.12

一种对具有批处理结构的高维正态分布数据(例如微阵列或RNA-seq数据)执行随机旋转的方法集合。随机旋转方法允许使用线性模型遵循任意批效应校正方法对相关测试统计量进行精确测试。

作者:Peter Hettegger [aut, cre]

维护者:Peter hetegger

引文(从R内,输入引用(“randRotation”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("randRotation")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“randRotation”)

PDF R脚本 随机旋转包简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BatchEffectBiomedicalInformaticsDifferentialExpressionGeneExpression遗传学MicroRNAArray微阵列归一化预处理RNASeq测序软件StatisticalMethod
版本 1.2.2
在Bioconductor BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 方法,图形,utils,统计,Rdpack(> = 0.7)
链接
建议 knitrBiocParallellme4nlmermarkdownBiocStyletestthat(> =魅惑,limma股东价值分析
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/phettegger/randRotation
BugReports https://github.com/phettegger/randRotation/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 randRotation_1.2.2.tar.gz
Windows二进制 randRotation_1.2.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra) randRotation_1.2.2.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/randRotation
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/randRotation
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/randRotation/
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