RGSEPD

doi：10.18129/b9.bioc.rgsepd

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅RGSEPD。

基因集富集 /投影显示

生物导体版本：3.12

R/GSEPD是用于R的生物信息学包装，可通过自动化差分表达式（使用DESEQ2），然后是基因集富集（带有GOSEQ），最后是N二维，来帮助解散歧义的转录组样品（转录本ID时RNA-Seq计数的矩阵）（RNA-Seq计数的矩阵）。投影以量化每个样品都像任何一种治疗组一样。

作者：卡尔·斯塔姆（Karl Stamm）

维护者：karl stamm

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rgsepd”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rgsepd”）

PDF	R脚本	RGSEPD软件包简介
PDF		参考手册
文本		读书我
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因烯，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，软件
版本	1.22.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（6年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 4.0.0），deseq2，，，，Goseq（> = 1.28）
进口	GPLOTS，，，，Biomart，，，，org.hs.eg.db，，，，go.db，，，，总结性特征，，，，哈希，，，，AnnotationDbi
链接
建议	引导， 工具，生物基因，，，，尼特，，，，Xtable
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	RGSEPD_1.22.0.TAR.GZ
Windows二进制	rgSEPD_1.22.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	RGSEPD_1.22.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgsepd
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rgsepd
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rgsepd/
软件包下载报告	下载统计