咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.roar

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见咆哮．

从rna序列比对中识别不同的APA用法

Bioconductor版本:3.12

从已知的备选位点和从标准RNA-seq实验中获得的序列出发，比较两种生物学条件，确定优先使用的APA位点。

作者:Elena Grassi

维护者:Elena Grassi < Grassi。E在gmail.com>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“咆哮”)

PDF	R脚本	从rna序列比对中识别不同的APA用法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	HighThroughputSequencing，RNAseq，测序，软件，转录
版本	1.26.0
在Bioconductor公司	BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.0.1)
进口	方法,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment，GenomicAlignments(> = 0.99.4),rtracklayer，GenomeInfoDb
链接
建议	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/vodkatad/roar/
全靠我
进口我	XBSeq
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	roar_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	roar_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	roar_1.26.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/roar
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/roar/
软件包下载报告	下载数据