scClassify

DOI:10.18129 / B9.bioc.scClassify

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见scClassify．

scclassification:单细胞分层分类

Bioconductor版本:3.12

scclassification是一种基于集成学习和细胞类型层次结构的单细胞RNA-seq数据的多尺度分类框架，支持使用多个引用进行精确细胞类型分类和联合细胞分类所需的样本量估计。

作者:林颖欣

维护者:Yingxin Lin < Yingxin。林在syney.edu.au >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" scclassified ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“scClassify”)

超文本标记语言	R脚本	pretrainedModel
超文本标记语言	R脚本	scClassify
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，GeneExpression，SingleCell，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	S4Vectors，limma，ggraph，igraph、方法、集群，minpack.lm，mixtools，BiocParallel，代理，proxyC，矩阵，ggplot2，hopach，diptest，mgcv，统计，图形，statmod
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，pkgdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/SydneyBioX/scClassify/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	scClassify_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	scClassify_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scClassify_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scClassify
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ scclassified
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scClassify/
软件包下载报告	下载数据