散粒

DOI:10.18129 / B9.bioc.scHOT

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见散粒．

单细胞高阶检验

Bioconductor版本:3.12

单细胞高阶检测(scHOT)是一个R包，可以沿着发育轨迹或跨空间检测基因表达的高阶结构的变化。scHOT本质上是通用和模块化的，可以在多个数据上下文中运行，如沿着连续轨迹、离散组之间和在空间方向上;以及适应任何更高阶的测量，如可变性或相关性。scHOT有意义地增加了一阶效应测试，如差分表达，并提供了从单细胞数据查询高阶相互作用的框架。

作者:Shila Ghazanfar [aut, cre]，林颖欣[aut]

维护:Shila Ghazanfar

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("scHOT")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(散粒)

超文本标记语言	R脚本	入门:scHOT
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录组
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	S4Vectors(> = 0.24.3),SingleCellExperiment，矩阵，SummarizedExperiment，IRanges，方法，统计，BiocParallel，重塑，ggplot2，igraphgrDevices,ggforce、图形
链接
建议	knitr，rmarkdown，嘘，scattermore，尺度，matrixStats，deldir
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	scHOT_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	scHOT_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scHOT_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scHOT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scHOT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scHOT/
软件包下载报告	下载数据