scp

DOI:10.18129 / B9.bioc.scp

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见scp．

基于质谱的单细胞蛋白质组学数据分析

Bioconductor版本:3.12

用于操作、处理和分析基于质谱的单细胞蛋白质组学(SCP)数据的实用函数。该包是为SCP应用程序设计的“QFeatures”包的扩展。

作者:Christophe Vanderaa [aut, cre]洛朗·盖托[au]

维护者:Christophe Vanderaa < Christophe。Vanderaa在uclouvain.be>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("scp")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“scp”)

超文本标记语言	R脚本	单细胞蛋白质组学数据处理与分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，GeneExpression，MassSpectrometry，预处理，蛋白质组学，SingleCell，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor公司	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，QFeatures
进口	方法，统计，效用，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，MultiAssayExperiment，S4Vectors，dplyr，magrittr，rlang
链接
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown，拼接而成，ggplot2，matrixStats，嫁祸于，嘘，股东价值分析，uwot
SystemRequirements
增强了
URL	https://UCLouvain-CBIO.github.io/scp
BugReports	https://github.com/UCLouvain-CBIO/scp/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	scp_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	scp_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scp_1.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scp
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scp . xml
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scp/
软件包下载报告	下载数据