scsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.scsR

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见scsR．

SiRNA对种子脱靶效应的校正

Bioconductor版本:3.12

修正了全基因组siRNA筛选的种子介导脱靶效应。适合的功能，以识别有效的种子/ mirna和可视化他们的影响也提供在包。

作者:Andrea Franceschini

维护者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb-sib。ch>， Roger Meier < Roger。Meier在lmsc.ethz。Christian von Mering in imls.uzh.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("scsR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	预处理，软件
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.14.0)，STRINGdb、方法、BiocGenerics，Biostrings，IRanges，plyr, tcltk
进口	sqldf，哈希，ggplot2，图形，grDevices，RColorBrewer
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scsR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scsR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/scsR/
软件包下载报告	下载数据