simpleaffy

DOI:10.18129 / B9.bioc.simpleaffy

这个包是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.12版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见simpleaffy．

Affymetrix数据的非常简单的高级分析

Bioconductor版本:3.12

提供读取Affy . cel文件、表型数据的高级函数，然后用它计算简单的东西，例如t检验、折叠变化等。充分利用affy图书馆。也有一些基本的散点图功能和机制，以产生高分辨率的期刊数字…

作者:Crispin J Miller

维护者:Crispin Miller

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“simpleaffy”)

PDF	R脚本	simpleaffy底漆
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	注释，DataImport，DifferentialExpression，微阵列，OneChannel，预处理，质量控制，ReportWriting，软件，转录，可视化
版本	2.66.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 16年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 2.0.0)，方法，utils, grDevices，图形，统计，BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase，affy(> = 1.33.6),genefilter，gcrma
进口	方法，utils, grDevices，图形，统计，BiocGenerics，Biobase，affy，genefilter，gcrma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
取决于我	yaqcaffy
进口我	affyQCReport，arrayMvout
建议我	AffyExpress，ArrayTools，肘
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	simpleaffy_2.66.0.tar.gz
Windows二进制	simpleaffy_2.66.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	simpleaffy_2.66.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simpleaffy
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ simpleaffy
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/simpleaffy/
包下载报告	下载数据