splineTimeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.splineTimeR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见splineTimeR．

利用样条回归模型对基因表达数据进行时程差异分析，然后进行基因关联网络重建

Bioconductor版本:3.12

该软件包提供了基因表达时间过程数据的差异基因表达分析功能。采用自然三次样条回归模型。鉴定出的基因可进一步用于通路富集分析和/或时间依赖性基因调控关联网络的重建。

作者:Agata Michna

维护者:Herbert Braselmann ， Martin Selmansberger < Martin。Selmansberger在helmholtz-muenchen.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("splineTimeR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“splineTimeR”)

PDF	R脚本	splineTimeR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，NetworkEnrichment，NetworkInference，回归，软件，TimeCourse
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)，Biobase，igraph，limma，GSEABase，gtools样条函数,GeneNet(> = 1.2.13),纵向(> = 1.1.12),金融中间人
进口
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	rmRNAseq
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	splineTimeR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	splineTimeR_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	splineTimeR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splineTimeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/splineTimeR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/splineTimeR/
软件包下载报告	下载数据