此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见经验丰富的人.
Bioconductor版本:3.12
stageR包允许自动分阶段分析高通量基因表达数据。该方法发表在https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1277-0的《基因组生物学》杂志上
作者:Koen Van den Berge和Lieven Clement
维护者:Koen Van den Berge < Koen。Vdberge在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“经验丰富的人”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("stageR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“经验丰富的人”)
超文本标记语言 | R脚本 | stageR:对R中高通量基因表达数据进行分期分析 |
参考手册 |
biocViews | 软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年) |
许可证 | GNU通用公共许可证第三版 |
取决于 | R (>= 3.4),SummarizedExperiment |
进口 | 方法,统计数据 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle、方法、Biobase,刨边机,limma,DEXSeq,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | rnaseqDTU |
进口我 | |
建议我 | MethReg |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | stageR_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | stageR_1.12.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | stageR_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stageR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/stageR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/stageR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: