突触

doi：10.18129/b9.bioc.synapter

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅突触。

无标签数据分析管道，用于最佳识别和定量

生物导体版本：3.12

突触软件包为在突触G2质谱仪上获取的无标签蛋白质组学数据提供了功能。可以将一次或几次运行使用附加的离子迁移率分开处理以提高识别精度，可以合并到其他定量文件，以最大化识别和定量精度。

作者：Laurent Gatto，Nick J. Bond，Pavel V. Shliaha和Sebastian Gibb。

维护者：laurent gatto 和sebastian gibb

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ intrapter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“突触”）

html	R脚本	使用“突触器”组合HDMSE/MSE数据以优化识别和定量
html	R脚本	使用“突触器”匹配片段
html	R脚本	Synapter2和Synergise2
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	免疫学，，，，质谱，，，，蛋白质组学，，，，QualityControl，，，，软件
版本	2.14.0
在生物导体中	Bioc 2.11（R-2.15）（8。5年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.1.0），方法，MSNBase（> = 2.1.2）
进口	rcolorbrewer，，，，格子，，，，QVALUE，，，，多检验，utils，工具，生物酶，，，，尼特，，，，生物弦，，，，切肉刀（> = 1.3.3），readr（> = 0.2），rmarkDown（> = 1.0）
链接
建议	SynapterData（> = 1.13.2），Xtable，，，，测试（> = 0.8），脑，，，，生物使用
系统要求
增强
URL	https://lgatto.github.io/synapter/
取决于我	SynapterData
进口我
建议我	proloc，，，，rforpoteomics
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Synapter_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	Synapter_2.14.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Synapter_2.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synapter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/突触器
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/synapter/
软件包下载报告	下载统计