transcriptogramer

DOI:10.18129 / B9.bioc.transcriptogramer

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见transcriptogramer．

基于转录图的转录分析

Bioconductor版本:3.12

R包用于基于转录图的转录分析，这是一种分析转录组的方法，将表达值投射到一组有序蛋白质上，其排列方式是，基因产物参与同一代谢途径的概率随着排序的两个蛋白质之间的距离的增加呈指数下降。因此，转录图是全基因组基因表达谱，提供了细胞代谢的全局视图，同时指示了表达被改变的基因集。

作者:Diego Morais [aut, cre]， Rodrigo Dalmolin [aut]

维护者:Diego Morais

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("转录本gramer")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“transcriptogramer”)

超文本标记语言	R脚本	转录记录器用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSetEnrichment，GraphAndNetwork，ImmunoOncology，微阵列，网络，RNASeq，软件，SystemsBiology，转录，可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.4)，方法
进口	biomaRt，data.table，doSNOW，foreach，ggplot2、图形、grDevicesigraph，limma平行,进步，红色的，雪统计数据,tidyr，topGO
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements	Java运行时环境(>= 6)
增强了
URL	https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer
BugReports	https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	transcriptogramer_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	transcriptogramer_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	transcriptogramer_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transcriptogramer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ transcriptogramer
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/transcriptogramer/
包下载报告	下载数据