发现

doi:10.18129/b9.bioc.uncoverapplib

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅发现

交互式图形应用,用于临床评估基本对级别序列覆盖范围

生物导体版本:3.12

一套闪亮的应用程序,其中包含一套图形和统计工具,以支持低覆盖区域的临床评估。它显示三个网页,每个网页提供了不同的分析模块:覆盖范围分析,通过等位基因频率应用程序和二项式分布计算AF。

作者:Emanuela Iovino [CRE,AUT],Tommaso Pippucci [aut]

维护者:emanuela iovino

引用(从r内,输入引用(“ uncoverapplib”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ uncoverapplib”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ uncoverapplib”)

html R脚本 发现
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 注解,,,,覆盖范围,,,,软件,,,,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看
进口 降价,,,,闪亮的,,,,Shinyjs,,,,丝绸,,,,闪亮的widgets,,,,Shinycsssloaders,,,,DT,,,,GVIZ,,,,同性恋,,,,OpenXLSX,,,,需求,,,,Stringr,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,Biocfilecache,,,,Rappdirs,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,rlist,utils,ensdb.hsapiens.v75,,,,ensdb.hsapiens.v86,,,,有机体,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,processx,,,,rsamtools,,,,基因组机
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,dplyr
系统要求
增强
URL https://github.com/manuelaio/uncoverapplib
BugReports https://github.com/manuelaio/uncoverapplib/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 uncoverApplib_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 uncoverApplib_1.0.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) uncoverApplib_1.0.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uncoverapplib
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/uncoverapplib
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/uncoverapplib/
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