vasp

doi:10.18129/b9.bioc.vasp

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅vasp

量化和可视化种群剪接变化

生物导体版本:3.12

从短读RNA-seq数据和基因剪接信息的可视化信息中发现全基因组变量的替代剪接事件,用于出版物质量的多面板图。

作者:Yu,Qian du,Chi Zhang

维护者:foxmail.com上的huihui yu

引用(从r内,输入引用(“ VASP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ vasp”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ VASP”)

html R脚本 人口剪接的变化
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,聚类,,,,差异性,,,,差速器,,,,免疫学,,,,kegg,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,软件,,,,统计信息,,,,可视化
版本 1.2.4
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(1年)
执照 GPL(> = 2.0)
要看 r(> = 4.0),舞会礼服
进口 iranges,,,,基因组机,,,,S4VECTORS,,,,寿司, 平行,矩阵,,,,基因组签名,,,,GenomeInfodB,,,,rsamtools,,,,,统计,图形,方法
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/yuhuihui2011/vasp
BugReports https://github.com/yuhuihui2011/vasp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 vasp_1.2.4.tar.gz
Windows二进制 vasp_1.2.4.zip
MacOS 10.13(高山脉) vasp_1.2.4.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/vasp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/vasp
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/vasp/
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