WigglePlotr

doi：10.18129/b9.bioc.wiggleplotr

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅WigglePlotr。

从Bigwig文件中读取覆盖范围

生物导体版本：3.12

可视化测序实验的读取覆盖范围以及基因组注释（基因，转录本，峰）的工具。长转录本的内含子可以重新缩放至固定长度，以更好地可视化外显子读覆盖范围。

作者：Kaur Alasoo [AUT，CRE]

维护者：gmail.com上的Kaur Alasoo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ wiggleplotr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ wiggleplotr”）

html	R脚本	WigglePlotr简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	替代方案，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，转录，，，，可视化
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（4年）
执照	Apache许可证2.0
要看	R（> = 3.6）
进口	dplyr，，，，GGPLOT2（> = 2.2.0），基因组机，，，，rtracklayer，，，，牛仔图，，，，断言，，，，purrr，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，Biomart，，，，GenomicFeatures，，，，测试，，，，Ensembldb，，，，ensdb.hsapiens.v86，，，，org.hs.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，AnnotationDbi，，，，AnnotationFilter
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	wigglePlotr_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	wigglePlotr_1.14.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	wigglePlotr_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wiggleplotr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/wiggleplotr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/wiggleplotr/
软件包下载报告	下载统计