GenomicState

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicState

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GenomicState。

构建和访问GenomicState对象，以便与来自Gencode等源的derfinder工具一起使用

Bioconductor版本:3.12

这个包包含从不同的注释源(如Gencode)构建GenomicState对象的函数。它还提供对JHPCE上这些文件的访问。

作者:莱昂纳多·科拉多-托雷斯[作家，作家]

维护者:莱昂纳多·科拉多-托雷斯

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GenomicState")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“GenomicState”)

超文本标记语言	R脚本	GenomicState简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData，AnnotationHub，Homo_sapiens，TxDb
版本	0.99.9
许可证	艺术- 2.0
取决于	AnnotationHub
进口	GenomicFeatures，GenomeInfoDb，rtracklayer，bumphunter，derfinder，AnnotationDbi，IRanges，org.Hs.eg.db， utils，方法
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，knitcitations，sessioninfo，testthat(> =魅惑,胶水，derfinderPlot，AnnotationHubData，RefManageR，GenomicRanges
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LieberInstitute/GenomicState
BugReports	https://github.com/LieberInstitute/GenomicState/issues
这取决于我
进口我	brainflowprobes，recountWorkflow
建议我	dasper
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	GenomicState_0.99.9.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GenomicState/
软件包下载报告	下载数据