MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38

GRCh38的次要等位基因频率数据来自gnomAD release 2.1

Bioconductor版本:3.12

从基因组聚集数据库(gnomAD release 2.1)中存储人类基因组版本GRCh38的次要等位基因频率数据。

作者:Robert Castelo

维护人员:Robert Castelo < Robert。Castelo网址:upf.edu b>

引用(来自R,输入引用(“MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AnnotationData遗传学GenomicScoresHomo_sapiens
版本 3.10.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5.0),GenomicScores(> = 1.9.6)
进口 跑龙套,S4VectorsIRangesGenomicRangesGenomeInfoDbBSgenome
链接
建议 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38
SystemRequirements
增强了
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这取决于我
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包档案

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源包 MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38_3.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38/
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