SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38

智人的SNP位点(dbSNP Build 149)

Bioconductor版本:3.12

NCBI dbSNP Build 149提取的智人SNP位点及等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2016年11月8日至12日创建,包含映射到参考基因组GRCh38的snp。p7 (GRCh38的补丁版本,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以被“注入”到BSgenome.Hsapiens.NCBI中。GRCh38或bsgenome . hspiens . ucsc .hg38。

作者:Hervé Pagès

维护人员:H. Pagès

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安装

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如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38")

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文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensSNPlocs
版本 0.99.20
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.43.4)
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsS4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
链接
建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 MafDb.1Kgenomes.phase1.GRCh38MafDb.1Kgenomes.phase3.GRCh38MafDb.ExAC.r1.0.GRCh38MafDb.ExAC.r1.0.nonTCGA.GRCh38MafDb.gnomAD.r2.1.GRCh38MafDb.gnomAD.r3.0.GRCh38MafDb.gnomADex.r2.1.GRCh38MafDb.TOPMed.freeze5.hg38MafH5.gnomAD.r3.0.GRCh38
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包档案

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源包 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38/
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