该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38。
Bioconductor版本:3.12
从NCBI dbSNP Build 150中提取的智人SNP位点和等位基因。该信息包使用的源数据文件由NCBI于2017年3月12日至14日创建,包含与参考基因组GRCh38相关的snp。p7 (GRCh38的修补版本,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以“注入”到BSgenome.Hsapiens.NCBI中。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。
作者:hervevev pag
维护者:H. pageries
引用(来自R,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38”)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放。
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,SNPlocs |
版本 | 0.99.20 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.43.4) |
进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | trena |
建议我 | |
链接到我 |
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源包 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38_0.99.20.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38/ |
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