SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38

智人SNP定位图(dbSNP Build 150)

Bioconductor版本:3.12

从NCBI dbSNP Build 150中提取的智人SNP位点和等位基因。该信息包使用的源数据文件由NCBI于2017年3月12日至14日创建,包含与参考基因组GRCh38相关的snp。p7 (GRCh38的修补版本,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以“注入”到BSgenome.Hsapiens.NCBI中。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。

作者:hervevev pag

维护者:H. pageries

引用(来自R,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensSNPlocs
版本 0.99.20
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.43.4)
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsS4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
链接
建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我 trena
建议我
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: