XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37

DOI:10.18129 / B9.bioc.XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37

智人的额外SNP位置(dbSNP Build 144)

Bioconductor版本:3.12

从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人额外SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月29日至30日创建,包含映射到参考基因组GRCh37的snp。p13 (GRCh37的修补版本,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。而snplc . hapiens . dbsnp144。GRCh37包仅包含“snp”类的分子变异,该包包含其他类的分子变异(in-del、杂合、微卫星、命名位点、无变异、混合和多核苷酸多态性)。

作者:Herve Pages

维护:H. Pages

引文(从R内,输入引用(“XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37")

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文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensXtraSNPlocs
版本 0.99.12
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),BSgenome
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsS4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
链接
建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
SystemRequirements
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包档案

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源包 XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37_0.99.12.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37/
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