该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38。
生物导体版本:3.12
从NCBI DBSNP构建中提取的Homo Sapiens的额外SNP位置和等位基因144.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2015年5月30日创建的,并包含用于参考Genome GRCH38.P2的SNP(grch38不会改变染色体1-22,x,y,mt)。虽然snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38套件仅包含“ SNP”类的分子变化,但该软件包包含其他类别的分子变化(二醇,杂合,杂合,微磷灰石,命名 - 洛克斯,nocus,not-cocus,not-cocus,not-cariation-not-cariation-not-cariation-caliation-clibiatide-climucletide-混合和多氨基核苷酸,多核核苷酸,多核核苷酸,多核核苷酸,多核纤维纤维透明质。多态性)。
作者:Herve页面
维护者:H。页面
引用(从r内,输入引用(“ xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38”))
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens,,,,Xtrasnplocs |
版本 | 0.99.12 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),BSGENOME |
进口 | 方法,utils,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME |
链接 | |
建议 | 生物弦,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38,,,,snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BSGENOME |
链接到我 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38_0.99.12.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/xtrasnplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38/ |
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