此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HiCDataHumanIMR90.
Bioconductor版本:3.12
人类成纤维细胞IMR90细胞系(hindii限制)的HiC数据从GEO网站检索,登录号为GSE35156 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35156)。原始读数按照Dixon等人(自然2012)的解释进行处理。
作者:Nicolas Servant
维护者:Nicolas Servant
引文(从R内,输入引用(“HiCDataHumanIMR90”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("HiCDataHumanIMR90")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HiCDataHumanIMR90”)
R脚本 | HiC数据人类成纤维细胞Dixon等,2012 | |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data |
版本 | 1.10.0 |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.10) |
进口 | |
链接 | |
建议 | HiTC |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | HiTC |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | HiCDataHumanIMR90_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiCDataHumanIMR90 |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HiCDataHumanIMR90 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/HiCDataHumanIMR90/ |
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