IHWpaper

DOI:10.18129 / B9.bioc.IHWpaper

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见IHWpaper

在IHW论文中复制数据

Bioconductor版本:3.12

这个包方便地包装了复制IHW论文(https://www.nature.com/articles/nmeth.3885)和最新arXiv预印本所需的所有功能,可在http://arxiv.org/abs/1701.05179获得。因此,它是Bioconductor IHW包的一个配套包。

作者:Nikos Ignatiadis

维护者:Nikos Ignatiadis < Nikos。Ignatiadis01在gmail.com>

引用(从R中,输入引用(“IHWpaper”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("IHWpaper")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“IHWpaper”)

超文本标记语言 R脚本 NMeth论文:解释tdr
超文本标记语言 R脚本 NMeth论文:IHW-Bonferroni模拟
超文本标记语言 R脚本 NMeth论文:真实数据示例
超文本标记语言 R脚本 NMeth论文:仿真图
超文本标记语言 R脚本 NMeth论文:分层直方图
超文本标记语言 R脚本 统计论文:hQTL分析与IHW-Benjamini-Yekutieli
超文本标记语言 R脚本 各种:BH解释/可视化
超文本标记语言 R脚本 各种各样:格林纳德估计应用于IHW (vs ECDF)
超文本标记语言 R脚本 多样化:真实数据示例:1倍权函数
超文本标记语言 R脚本 多种:tdr和pvalue拒绝区域
超文本标记语言 R脚本 多样化:权重vs独立过滤
PDF 参考手册

细节

biocViews ExperimentDataExpressionDataRNASeqDataReproducibleResearch
版本 1.18.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3),IHW
进口 Rcpp,统计,样条,方法,utils,DESeq2SummarizedExperimentfdrtoolgenefilterqvalueBiobaseBiocGenericsBiocParalleldplyr、网格ggplot2cowplot
链接 Rcpp
建议 testthatRColorBrewerwesanderson尺度gridExtraBiocStyleknitrrmarkdown气道pasillaDESeqlocfdrtidyrggbiolatex2exp
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 IHWpaper_1.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/IHWpaper
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IHWpaper
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/IHWpaper/
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