此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见IHWpaper.
Bioconductor版本:3.12
这个包方便地包装了复制IHW论文(https://www.nature.com/articles/nmeth.3885)和最新arXiv预印本所需的所有功能,可在http://arxiv.org/abs/1701.05179获得。因此,它是Bioconductor IHW包的一个配套包。
作者:Nikos Ignatiadis
维护者:Nikos Ignatiadis < Nikos。Ignatiadis01在gmail.com>
引用(从R中,输入引用(“IHWpaper”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("IHWpaper")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“IHWpaper”)
超文本标记语言 | R脚本 | NMeth论文:解释tdr |
超文本标记语言 | R脚本 | NMeth论文:IHW-Bonferroni模拟 |
超文本标记语言 | R脚本 | NMeth论文:真实数据示例 |
超文本标记语言 | R脚本 | NMeth论文:仿真图 |
超文本标记语言 | R脚本 | NMeth论文:分层直方图 |
超文本标记语言 | R脚本 | 统计论文:hQTL分析与IHW-Benjamini-Yekutieli |
超文本标记语言 | R脚本 | 各种:BH解释/可视化 |
超文本标记语言 | R脚本 | 各种各样:格林纳德估计应用于IHW (vs ECDF) |
超文本标记语言 | R脚本 | 多样化:真实数据示例:1倍权函数 |
超文本标记语言 | R脚本 | 多种:tdr和pvalue拒绝区域 |
超文本标记语言 | R脚本 | 多样化:权重vs独立过滤 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,ExpressionData,RNASeqData,ReproducibleResearch |
版本 | 1.18.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3),IHW |
进口 | Rcpp,统计,样条,方法,utils,DESeq2,SummarizedExperiment,fdrtool,genefilter,qvalue,Biobase,BiocGenerics,BiocParallel,dplyr、网格ggplot2,cowplot |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,RColorBrewer,wesanderson,尺度,gridExtra,BiocStyle,knitr,rmarkdown,气道,pasilla,DESeq,locfdr,tidyr,ggbio,latex2exp |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | IHWpaper_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/IHWpaper |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IHWpaper |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/IHWpaper/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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