此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PCHiCdata.
Bioconductor版本:3.12
启动子捕获Hi-C数据的子集为芝加哥用户方便地打包。数据包括GM12878细胞中检测到的染色体20和21的相互作用,以及mESC中检测到的染色体18和19的相互作用。
作者:Paula Freire-Pritchett, Jonathan Cairns, Steven Wingett, Mikhail Spivakov
维护者:Paula Freire-Pritchett < Paula . Freire-Pritchett at babraham.ac.uk>
引用(从R中,输入引用(“PCHiCdata”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PCHiCdata")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“PCHiCdata”)
超文本标记语言 | R脚本 | PCHiCdata装饰图案 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,Homo_sapiens_Data,Mus_musculus_Data,SequencingData,干细胞的 |
版本 | 1.18.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.2),芝加哥 |
进口 | |
链接 | |
建议 | testthat,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 芝加哥 |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | PCHiCdata_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/PCHiCdata |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PCHiCdata |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PCHiCdata/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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