此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见leeBamViews.
Bioconductor版本:3.12
数据来自midid 19096707;用于管理多个NGS样本的原型
作者:VJ Carey
维护者:VJ Carey
引文(从R内,输入引用(“leeBamViews”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("leeBamViews")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“leeBamViews”)
R脚本 | 使用bamViews管理多个NGS样本 | |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,RNASeqData,SNPData,Saccharomyces_cerevisiae_Data,SequencingData |
版本 | 1.26.0 |
许可证 | 艺术2.0 |
取决于 | R (>= 2.15.0),Biobase,Rsamtools(> = 0.1.50),BSgenome |
进口 | GenomicRanges,GenomicAlignments、方法、S4Vectors平行,IRanges |
链接 | |
建议 | biomaRt,org.Sc.sgd.db,刨边机 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | EDASeq |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | leeBamViews_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/leeBamViews |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/leeBamViews |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/leeBamViews/ |
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