该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅pasillabamsubset。
生物导体版本:3.12
BAM文件的子集未经处理1.BAM(单端读取)和未处理的3.bam(配对末端读取)来自“ Pasilla”实验(Brooks等人的Pasilla敲除,基因组研究,2011年)。有关BAM文件未处理1.bam和Un-treated3.bam,请参见Pasilla数据包中的小插图,从RNA-Seq读取序列数据获得,该序列数据由NCBI基因表达式综合在登录号GSM461176下提供给GSM46111181。还包含可以映射读数的蝇染色体4的DNA序列。
作者:HervéPagès
维护者:hervépagès
引用(从r内,输入引用(“ pasillabamsubset”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pasillabamsubset”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | dnaseqdata,,,,实验数据,,,,基因组,,,,rnaseqdata |
版本 | 0.28.0 |
执照 | LGPL |
要看 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | 帕西拉 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,基因组机,,,,Gmoviz,,,,iranges,,,,核粒子,,,,plyranges,,,,transview |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | pasillabamsubset_0.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pasillabamsubset |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pasillabamsubset |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pasillabamsubset/ |
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