pasillabamsubset

doi:10.18129/b9.bioc.pasillabamsubset

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅pasillabamsubset

来自“ pasilla”实验的BAM文件子集

生物导体版本:3.12

BAM文件的子集未经处理1.BAM(单端读取)和未处理的3.bam(配对末端读取)来自“ Pasilla”实验(Brooks等人的Pasilla敲除,基因组研究,2011年)。有关BAM文件未处理1.bam和Un-treated3.bam,请参见Pasilla数据包中的小插图,从RNA-Seq读取序列数据获得,该序列数据由NCBI基因表达式综合在登录号GSM461176下提供给GSM46111181。还包含可以映射读数的蝇染色体4的DNA序列。

作者:HervéPagès

维护者:hervépagès

引用(从r内,输入引用(“ pasillabamsubset”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pasillabamsubset”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 dnaseqdata,,,,实验数据,,,,基因组,,,,rnaseqdata
版本 0.28.0
执照 LGPL
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源包 pasillabamsubset_0.28.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pasillabamsubset
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pasillabamsubset
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pasillabamsubset/
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