pathprintGEOData

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprintGEOData

这个包是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.12版本。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见pathprintGEOData．

路径指纹向量表示来自GEO数据存储库的阵列的分段

Bioconductor版本:3.12

路径指纹向量已经从GEO语料库中预先计算了约390,000个公开可用的阵列，跨越6个物种和31个平台。所有数据都伴随着它们相关的元数据。

作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis

维护者:Sokratis Kariotis

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install(" BiocManager") BiocManager::install("pathprintGEOData")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“pathprintGEOData”)

PDF	R脚本	pathprintGEOData
PDF		参考手册

细节

biocViews	Caenorhabditis_elegans_Data，Danio_rerio_Data，Drosophila_melanogaster_Data，ExperimentData，ExpressionData，地理，基因组，Homo_sapiens_Data，MicroarrayData，Mus_musculus_Data，OneChannelData，PathwayInteractionDatabase，Rattus_norvegicus_Data，SequencingData，TwoChannelData
版本	1.20.0
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.4)
进口
链接
建议	pathprint，SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	pathprint
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	pathprintGEOData_1.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprintGEOData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pathprintGEOData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pathprintGEOData/
包下载报告	下载数据